Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crisp3Q03402 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms