Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabpb1Q00420 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb1Q00420 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms