Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
rp9P97762 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
rp9P97762 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
rp9P97762 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
rp9P97762 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
rp9P97762 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
rp9P97762 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
rp9P97762 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
rp9P97762 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
rp9P97762 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
rp9P97762 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
rp9P97762 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
rp9P97762 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
rp9P97762 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
rp9P97762 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
rp9P97762 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
rp9P97762 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
rp9P97762 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
rp9P97762 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
rp9P97762 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
rp9P97762 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
rp9P97762 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
rp9P97762 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
rp9P97762 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms