Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Taf1bP97358 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf1bP97358 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms