Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps11P62281 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms