Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2mP61082 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2mP61082 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms