Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcmtd1P59913 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms