Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod1P49813 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms