Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh1P48985 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms