Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd27P41272 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd27P41272 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd27P41272 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms