Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tacr1P30548 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tacr1P30548 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms