Protein–RNA interactions for Protein: P28662

Bri3, Brain protein I3, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bri3P28662 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bri3P28662 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bri3P28662 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bri3P28662 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bri3P28662 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms