Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept4P28661 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept4P28661 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept4P28661 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms