Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb9P28076 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms