Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PparaP23204 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PparaP23204 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PparaP23204 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PparaP23204 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PparaP23204 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PparaP23204 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PparaP23204 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PparaP23204 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PparaP23204 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PparaP23204 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PparaP23204 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PparaP23204 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PparaP23204 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PparaP23204 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PparaP23204 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PparaP23204 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PparaP23204 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PparaP23204 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PparaP23204 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PparaP23204 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms