Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phka1P18826 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phka1P18826 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phka1P18826 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phka1P18826 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phka1P18826 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms