Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spi1P17433 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms