Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhoP15409 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RhoP15409 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhoP15409 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RhoP15409 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhoP15409 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhoP15409 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhoP15409 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhoP15409 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhoP15409 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhoP15409 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhoP15409 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhoP15409 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhoP15409 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhoP15409 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhoP15409 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RhoP15409 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhoP15409 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhoP15409 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhoP15409 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms