Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AppP12023 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AppP12023 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AppP12023 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AppP12023 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AppP12023 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AppP12023 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AppP12023 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AppP12023 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AppP12023 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AppP12023 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AppP12023 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AppP12023 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AppP12023 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AppP12023 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AppP12023 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AppP12023 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AppP12023 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AppP12023 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AppP12023 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AppP12023 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AppP12023 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AppP12023 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AppP12023 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms