Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR5

Tdpoz1, TD and POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz1P0DMR5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdpoz1P0DMR5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdpoz1P0DMR5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms