Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2aP08775 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms