Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamc1P02468 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lamc1P02468 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lamc1P02468 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms