Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FosP01101 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FosP01101 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FosP01101 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FosP01101 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FosP01101 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FosP01101 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FosP01101 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FosP01101 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FosP01101 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FosP01101 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FosP01101 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FosP01101 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FosP01101 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FosP01101 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FosP01101 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FosP01101 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FosP01101 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FosP01101 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FosP01101 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FosP01101 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FosP01101 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FosP01101 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FosP01101 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FosP01101 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FosP01101 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FosP01101 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FosP01101 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FosP01101 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FosP01101 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FosP01101 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FosP01101 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FosP01101 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FosP01101 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FosP01101 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms