Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Vamp4O70480 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vamp4O70480 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms