Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BckdkO55028 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BckdkO55028 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms