Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap6O54834 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms