Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tpd52l1O54818 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpd52l1O54818 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms