Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rabep1O35551 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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