Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms