Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac1O09106 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac1O09106 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms