Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efna4O08542 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna4O08542 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna4O08542 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna4O08542 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna4O08542 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms