Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930544D05RikJ3QK56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms