Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610008E11RikG3X964 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610008E11RikG3X964 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610008E11RikG3X964 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.3 ms