Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5218F6YH22 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms