Protein–RNA interactions for Protein: F6PZL4

Gm15448, Predicted gene 15448, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15448F6PZL4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm15448F6PZL4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm15448F6PZL4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15448F6PZL4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms