Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh18E9Q9Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 538.5 ms