Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r1E9PVR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms