Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hfm1D3Z4R1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hfm1D3Z4R1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hfm1D3Z4R1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms