Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms