Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apba1B2RUJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms