Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otud4B2RRE7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms