Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC035947B2RQY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC035947B2RQY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms