Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms