Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdccag3A2AIW0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdccag3A2AIW0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms