Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LJ36

Gm45208, PRA1 family protein, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45208A0A140LJ36 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45208A0A140LJ36 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45208A0A140LJ36 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45208A0A140LJ36 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm45208A0A140LJ36 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm45208A0A140LJ36 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm45208A0A140LJ36 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm45208A0A140LJ36 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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