Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H8

Igkv1-133, Immunoglobulin kappa variable 1-133 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igkv1-133A0A0B4J1H8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-133A0A0B4J1H8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms