Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec2Q9WV35 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms