Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms