Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cry2Q9R194 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms