Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Gpc1Q9QZF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc1Q9QZF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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Gpc1Q9QZF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Gpc1Q9QZF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Gpc1Q9QZF2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc1Q9QZF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Gpc1Q9QZF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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